1、细菌性软腐病
病菌从伤口侵入，因为枝条表层肥料，被弄破露出木质部，木质部颜色不便，当病斑发展扩大或绕茎干一周时，会散发出腥臭味，也会造成果实染病，呈软腐状。
防治方法：和豆类蔬菜或水稻等轮作，免与茄科或十字花科作物轮作，同时加强田间管理，合理密植，雨后排水，加强通透性，及时摘除病果病株带出田间烧毁。在结果雨前雨后，及时喷药防治，可用农用链霉素或可杀得三千交替使用。
2、疫病
疫病发病急。发展快，多发于咋主干和主茎的“节”部位，病斑呈深褐色或黑褐色，皮层不软腐，木质部变深褐色，病斑开始不凹陷，能生稀疏白霉毛，但在干燥环境下比较少见。
防治方法：同样要实行轮作，合理密植，加强肥水管理，增施有机肥，发现病株后，可以选择保护地采用烟雾法，亩施用45％百菌清烟剂，每亩次200-250克，预防或熏治。采用粉尘法，或者喷撒5％百菌清粉尘剂每亩次1公斤。
3、菌核病
菌核病一般发生在枝条分叉处，开始为灰白色软腐症状，后逐渐生长出白色的霉层，继而聚集产生鼠粪状菌核，病斑下木质部朽烂、干枯，同时也能侵染果实和叶片，使其腐烂。
防治方法：深翻土壤，使得菌核不能，萌发，清除种子种的菌核，避免其混入，排水降湿，清除病叶、病果以及病株，及时深埋或烧毁。在发病初期可以选择施佳乐、嘉美金点或农利灵、腐霉利等药剂喷雾防治，每隔7-10天一次，连续2-3次。
4、灰霉病
这种病害多由残花生霉后落在茎干上而引发，也有些是由于老灰霉病斑处滴水而传染到茎部，从果柄处侵入，引起茎杆腐烂，病斑浅褐色，不凹陷，着生灰色浓密霉毛，绕茎一周后，上部干枯。
防治方法：应采用高畦栽培，并覆盖地膜，以提高地温，降低湿度，做好棚室温湿度调控，上午保持高温，下午延长放风时间，加大通风量，夜间适当提高温度，减轻叶面结露。发病后及时摘除病果、病叶以及侧枝，及时烧毁或深埋，再喷施药剂防治。
